恢复高考后，最初的临床医学研究生教育主要是科研和临床结合，招生对象也大多针对有过数年临床经验的医生,不招收应届毕业生，目的是对已经有一定临床经验的医生进行科研素养教育，培养出既能从事临床工作，又能从实践中发现问题，或将自己的理论研究用于临床的高素质医务工作者。1998年，为适应社会对高层次临床医师的需要，国务院学位委员会正式颁布《关于调整医学学位类型和设置医学专业学位的几点意见》，同时出台了《临床医学专业学位试行办法》，改变了过去临床医学研究生培养的单一学位制，完善了我国临床医学专业学位研究生的培养制度。其目的是逐步完善医学学位制度，加快培养临床医学高层次人才，提高临床医疗队伍的科研素质和临床医疗水平。2009年，本科全日制专业学位研究生制度实施，专业学位研究生制度得到更快的发展。自从科学型和专业型临床医学研究生培养制度设立和试行以来，为我国医疗卫生事业培养了大量高层次应用型医学人才，但由于各院校、各专业、导师对于两类医学研究生的要求不同，国家也没有统一的培养要求和毕业标准，在培养过程中存在一些问题，影响了我国临床医学研究生的培养质量。临床医学专业学位教育以伟德国际吧 为依托，是伟德国际吧 性的职业教育，主要目标是提高研究生的临床医学实际工作能力，学生在学习少量课程后大部分时间在临床实习转科，同时根据各院校或导师的要求，从事部分科研工作。而科学型学生任务较重，一般都需要承担导师的课题任务，同时也要参加临床实习。前者学习任务轻，学校要求所学的学分少，后者需要付出更多的精力和时间。对于专业型的研究生，多数学校没有严谨的临床技能考核标准、临床工作中忙于应付大量的日常琐碎工作，真正的临床技能培训欠缺，最后导致临床技能提高不大，科研能力更无从谈起。少数导师不重视临床技能培训，要求专业型的研究生必须进入实验室从事科研工作，造成培养目的不明确，专业型和科学型不分，达不到国家设立两种学位的初衷。少数专业型的学生因为毕业论文的要求也相应偏低，对于科研课题被动应付，未能真正提高自己的科研能力，最后的结果是专业学位的培养和住院医差不多，有研究生之名，无研究生之实。对于科学型研究生，由于社会资源的分配并不一致，今后从事科研为主的职业和临床医生之间的收入存在一定差别，绝大多数招收为科学型的研究生，今后的人生计划还是以做临床医生为主。很多进入临床医学攻读学位的研究生，因为专业型学位有指标数量限制，是被动地被招收为科学型研究生，其目的是“曲线”进入临床，而不是真正地喜欢基础研究，拿到研究生学位就业时，即转入临床岗位，因此在校学习期间，用于科研实验和临床工作的时间有所偏倚，多数研究生希望更多地在临床工作中接受锻炼。这样就造成临床医学研究生用于实验的时间偏少，科研素质得不到应有的提高。为了使科学型的临床医学研究生能踏实地进行科研工作，国家也出台了科学型研究生不能以该学历报考执业医师的规定，然而这一规定并不能限制具有本科临床医学学位的研究生报考，反而会使科学型研究生更加不重视研究生期间的教育，从而将研究生学习作为跳板，而不是踏踏实实地专心于科学研究。
由于医学研究自身的特点，决定了其课题资金投入多，一个试剂盒就可能需要数千元至上万元，而产出少甚至无产出。个别导师申请课题不积极，手中无课题无经费无实验场地，研究生做实验像游击战，到处找实验室，甚至自筹实验经费。其次，国家将医疗服务定位于医疗消费，将医院推向市场，由市场经济推动医疗服务的发展，势必造成医院追求利润最大化，同时节制成本和支出。医院管理部门对于支出多产出少的科研活动，自然会持消极态度。对于科研设备的购买、日常维护常常吝于投入，使院内实验室的科研环境恶化，甚至难于维持正常的实验。